各镇(街道、区)政府：负责对本行政区域内新农合制度的宣传发动、基金筹集工作，确保参合率达到98%以上，力争使全部农民享有新农合的权利。

卫生部门：负责制定完善各项规章制度，定点医疗机构医疗服务的指导和监督，工作人员的业务培训及统筹基金的管理。

财政部门：负责全市新农合基金的市级统筹和管理、财务制度的制定，及时划拨参合农民补助资金和市、镇两级合管办人员工资及业务经费，及时、足额拨付报销支出，积极筹措医疗救助资金和“大病救助”基金。

人社部门：根据实际工作需要，及时增加经办机构编制，不断完善经办队伍建设。

农业部门：配合镇政府有关部门做好宣传工作，动员和引导农民积极参加新农合。

民政部门：确保低保资金、重点优抚对象资金和福利彩票留成资金及时到位，做好医疗救助工作，动员社会团体及个人捐助“大病救助”基金和医疗救助资金。

审计部门：对新农合基金的管理使用情况进行审计监督。

药监部门：加强药品质量的监管，规范购销渠道，规范药品的使用;进一步加大药品监督管理力度，依法取缔非法药品生产经营、销售单位，杜绝假冒伪劣药品进入医药市场和医疗机构，确保农民用药安全有效。

物价部门：监督新农合定点医疗机构的医疗收费和药品价格，严厉查处价格违法违规行为。

宣传部门：做好新农合制度的宣传工作，及时报道新农合工作的进展，发现和宣传工作中的经验做法和典型事例。