一、合伙协议和合伙人之间协商的，而公司章程是在公司层面上制定的，两者的协议范围不同。

二、合伙协议是依法由全体合伙人协商一致、以书面形式订立的合伙企业的契约。

三、公司章程，是指公司依法制定的、规定公司名称、住所、经营范围、经营管理制度等重大事项的基本文件，也是公司必备的规定公司组织及活动基本规则的书面文件。

合伙企业和非合伙企业怎样退还财产？

合伙企业中，合伙人若是退伙，退还财产的方式有：退还货币或者退还实物。财产份额的具体退还办法，由合伙协议约定或者由全体合伙人决定。合伙人退伙，其他合伙人应当与该退伙人按照退伙时的合伙企业财产状况进行结算，退还退伙人的财产份额，退伙人对给合伙企业造成的损失负有赔偿责任的，相应扣减其应当赔偿的数额。

《中华人民共和国公司法》第二十九条股东认足公司章程规定的出资后，由全体股东指定的代表或者共同委托的代理人向公司登记机关报送公司登记申请书、公司章程等文件，申请设立登记。