税务部门不能申请企业破产。根据我国《破产法》的有关规定，能够申请企业破产的只有三类人，分别是公司本身、债权人和依法负有清算责任的人。《中华人民共和国企业破产法》第七条：债务人有本法第二条规定的情形，可以向人民法院提出重整、和解或者破产清算申请。债务人不能清偿到期债务，债权人可以向人民法院提出对债务人进行重整或者破产清算的申请。企业法人已解散但未清算或者未清算完毕，资产不足以清偿债务的，依法负有清算责任的人应当向人民法院申请破产清算。

税务部门组织的税收收入不包括

税务部门组织的税收收入不包括出口退税。税务部门组织的税收收入包括国内增值税、企业所得税、个税等收入，没有出口退税，税务局要退回这个税额，而对于企业来说，可以当做是一项收入。

税务部门组织的税收收入内容包括增值税税收收入、企业所得税税收收入、消费税税收收入、印花税税收收入、个人所得税税收收入、资源税税收收入、城镇土地使用税税收收入、房产税税收收入等。税收收入指国家凭借其政治权力，依据法定标准从单位和个人无偿取得的一种财政收入。由于各地税务部门组织的税收收入占各地政府财政收入的重要部分，因此对于各地纳税人纳税义务的监督都是各地税务机关的重点工作之一，对于不按照规定依法申报和缴纳税款的纳税人，税务机关会按照一定的比例对其收取罚金或滞纳金。

法律依据：《中华人民共和国税收征收管理法》第一条

为了加强税收征收管理，规范税收征收和缴纳行为，保障国家税收收入，保护纳税人的合法权益，促进经济和社会发展，制定本法。

第二条

凡依法由税务机关征收的各种税收的征收管理，均适用本法。

第三条

税收的开征、停征以及减税、免税、退税、补税，依照法律的规定执行；法律授权国务院规定的，依照国务院制定的行政法规的规定执行。

《中华人民共和国企业破产法》

第七条债务人有本法第二条规定的情形，可以向人民法院提出重整、和解或者破产清算申请。

债务人不能清偿到期债务，债权人可以向人民法院提出对债务人进行重整或者破产清算的申请。

企业法人已解散但未清算或者未清算完毕，资产不足以清偿债务的，依法负有清算责任的人应当向人民法院申请破产清算。