公安机关对非法集资案件进行立案侦查后，如果非法集资案件是非常重大的案件，涉及的资金是非常巨大的，就会全国协查。

相关法律规定

《中华人民共和国刑事诉讼法》

第二十条基层人民法院管辖第一审普通刑事案件，但是依照本法由上级人民法院管辖的除外。

第二十一条中级人民法院管辖下列第一审刑事案件：

(一)危害国家安全、恐怖活动案件；

(二)可能判处无期徒刑、死刑的案件。

第二十二条高级人民法院管辖的第一审刑事案件，是全省(自治区、直辖市)性的重大刑事案件。

第二十三条最高人民法院管辖的第一审刑事案件，是全国性的重大刑事案件。