宅基地确权不算二套房。如果是在农村宅基地上自建的房子，是没有商品房产权证的。所以，只要符合限购条件，没有其他商品房产，购买商品房是不算二套房的。二套房是第二套普通自住房的简称，是指以借款人家庭为单位认定的，借款人家庭人均住房面积高于当地平均水平的，再次向商业银行申请住房贷款的房贷房。

宅基地确权有争议如何解决吗？

1、协商解决：公民间发生的宅地纠纷，必须首先通过协商的方式解决。

2、行政解决：个人间、个人与单位间的纠纷，由乡级人民政府或县级以上人民政府处理。

3、司法解决：当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自收到处理决定通知之日起30日内向人民法院起诉。

《中华人民共和国土地管理法》第十四条土地所有权和使用权争议，由当事人协商解决；协商不成的，由人民政府处理。

单位之间的争议，由县级以上人民政府处理；个人之间、个人与单位之间的争议，由乡级人民政府或者县级以上人民政府处理。

当事人对有关人民政府的处理决定不服的，可以自接到处理决定通知之日起三十日内，向人民法院起诉。

在土地所有权和使用权争议解决前，任何一方不得改变土地利用现状。

《确定土地所有权和使用权的若干规定》第四十九条接受转让、购买房屋取得的宅基地，与原有宅基地合计面积超过当地政府规定标准，按照有关规定处理后允许继续使用的，可暂确定其集体土地建设用地使用权。继承房屋取得的宅基地，可确定集体土地建设用地使用权。