不能。若借款人在购买第一套房时，也是使用公积金贷款购买的，并且还完贷款，则在购买第二套房屋时，就不能使用公积金来贷款并用来还房贷。若第一套房是用商业贷款买的，并且正在按揭中，则第二套房可以使用公积金贷款。

一、第三套房的认定标准

1、个人名下有两套商业贷款记录，一套已还清并出售，另一套未还清，这种情况如若再次贷款，视为第三套房。2、个人名下有两套商业贷款记录，全都已经还清了，而且出售，虽然能够提供两套住房出售证明，个人名下无房产，但再贷款时视为第三套房。3、个人名下有一套商业贷款已还清，另一套是公积金贷款也已经还清，借款人想要用公积金贷款购买另外一套房产，视为第三套房。4、个人名下首套房公积金贷款，二套房商业贷款，再次贷款还准备用商业贷款的话，视为第三套房。5、夫妻双方，婚前一方使用商业贷款购房，另一方购房用的是公积金贷款，婚后两人想要以夫妻的名义共同贷款，视为第三套房。6、夫妻双方，一方婚前有房但无任何贷款未出售，另一方曾用商业贷款为父母买过房产，结婚后以无贷款的那一方名义用公积金贷款再购房。根据公积金贷款的现行政策，无论个人名下房产是否已出售，贷款是否已还清卖掉，均视为第三套房

二、公积金贷款最长年限是多久

公积金贷款最长年限用以新建房屋抵押期限不超30年。

以购买的新建住房作为抵押贷款发放的住房公积金贷款，贷款期限一般不得超过借款人自住房公积金贷款发放之日起至法定退休年龄的期限，最长不得超过30年；以借款人第二财产或第三财产作为抵押贷款发放的委托贷款，贷款期限不得超过抵押财产的剩余使用年限，最长不得超过15年；以凭证国债或银行定期存单质押的，贷款期限最长不得超过凭证国债或银行定期存单的到期日。

三、北京二套房政策是什么

北京二套房政策是以下两点：

1、二套房最低首付调整到六成。对拥有一套住房且相应购房贷款未结清的居民家庭，为改善居住条件再次申请商业性个人住房贷款购买普通自住房，最低首付款比例调整为不低于60%；购买非普通自住房的首付款比例不低于80%；

2、二套房公积金贷款降至两成。

买二套房要注意贷款方法，现在贷款方法主要分为；公积金贷款、个人商业贷款、组合贷款，因为二套房申请贷款的话，其首付款额度和贷款利率都会高不少，非常是申请个人商业贷款采购的话，是更高的，而选择住房公积金贷款的话，依然可以享有相关的贷款优惠条件，只要第一套是用了商业贷款，二套房用住房公积金按揭，就能按照首套贷款政策来执行。