股权确认纠纷证据有：

1、股东名册以公司股东名册的记载来确认股东的资格，得到了世界范围内公司法律的广泛认可。各国法律普遍认为，股东名册具有当然授予股东资格的法律效力。

2、公司章程章程是公司作为社团法人最为主要的象征之一，被称为公司的宪法。

3、出资证明书我国公司法规定，有限公司成立后应当向股东签发出资证明书。出资证明书应当包含股东的姓名或者名称、缴纳的出资额和出资日期等内容。

一、隐名出资人如何去证明出资行为

隐名出资人可以依据其与名义出资人之间的隐名投资合同或者其他出资事实证明其为真正的出资人。有限责任公司股东资格的确认，涉及实际出资额、股权转让合同、公司章程、股东名册、出资证明书、工商登记等。确认股东资格应综合考虑多种因素，在具体案件中对事实证据的审查认定，应当根据当事人具体实施民事行为的真实意思表示，选择确认股东资格的标准。

二、有限责任公司股权转让需要什么手续

有限责任公司股权转让需要办理股东名册、公司章程、工商登记三个变更手续。股东向股东以外的人转让股权，应当经其他股东过半数同意。股东应就其股权转让事项书面通知其他股东征求同意，其他股东自接到书面通知之日起满三十日未答复的，视为同意转让。转让股权后，公司应当注销原股东的出资证明书，向新股东签发出资证明书，并相应修改公司章程和股东名册中有关股东及其出资额的记载。