存疑不起诉是可以算结案的。存疑不起诉，又称证据不足的不起诉。存疑不起诉是检察机关对于经过补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，作出的不起诉决定。但检查机关如果发现了新的证据是可以起诉的。

一、检察院驳回起诉二次后是否可以放人

根据法律规定，人民检察院审查案件，对于需要补充侦查的，可以退回公安机关补充侦查，补充侦查以二次为限。对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。如果被不起诉人在押，应当立即释放。

二、盗窃罪不起诉档案能查到吗

盗窃犯罪属于刑法规制范畴，不属于民事行为可以私法自治。即使被害人书面谅解，检察机关也要提起公诉，移送法院定罪量刑。但是盗窃罪也有不起诉的情形，法律规定，有下列情形之一的，应当不起诉：(一)情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；(二)犯罪已过追诉时效期限的；(三)经特赦令免除刑罚的；(四)犯罪嫌疑人死亡的；(五)犯罪嫌疑人没有犯罪事实（六）其他法律规定免予追究刑事责任的对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。如果检察机关或是受害人不起诉的，法院无权直接判决他人有罪。

三、存疑不起诉是否申请国家赔偿

存疑不起诉可以申请国家赔偿。存疑不起诉，是指检察院在行为人案件事实不清、证据不足的情况下，决定不起诉。在这种情况下，行为人被拘留属于无罪性质，当然可以要求国家赔偿，即国家侵权损害赔偿，这是国家对行使公共权利的侵权行为所造成的伤害承担赔偿责任的行为。国家赔偿的主要方式是支付赔偿金，财产能够返还或者恢复原状的，应当给予返还或者恢复原状。