如果公司规章里规定了三天旷工属于自动离职，那么按照公司章程规定处理。

一、员工不来上班公司如何处理

公司应该先与员工提供，提醒不来上班的不合理性以及影响，如果员工任然不改可以以旷工来对员工进行考核，如果员工在一定时间内超过合同里的旷工天数，那么公司可以依照劳动合同的规定，与劳动者解除合约，如果劳动者与用人单位失去联系，那么就可以通过法院来宣判劳动关系结束。任何用人单位与劳动者关系解除劳务关系的，都必须经过完整正规的流程，双方签订了解除劳动合同的证明，这样才算是员工正式离开用人单位。

二、员工自动离职怎么办

员工自动离职，企业应该做的是：1、首先企业应给员工发送《限期返岗通知书》，限定日期返回工作岗位；2、若员工未按要求返岗，开始计算员工旷工天数，达到可以解除劳动合同的天数（天数视自己企业的规章制度规定确定，一般连续旷工3天以上）后给员工发送《解除劳动合同通知书》，可以先选择人为送达的方式送到家里，如果没有人，再用EMS送，如果员工签收了，那么程序结束，如果没有签收还要走60天报纸公告程序。以上各种方式要留存未送达的凭据。

三、迟到可以算旷工吗

具体要按公司的规章制度来看。所谓旷工，就是指劳动者未经请假即缺勤，缺勤就是劳动者应到却未到岗工作。判断劳动者是否到岗工作并不以是否有考勤记录作为唯一标准，关键在于是否到岗工作、是否应出勤而未出勤。在劳动法中没有规定旷工多少天算自动离职，只有用人单位在制定的规章制度里或者劳动合同里有注明，得看签订合同的情况。