基础和主体结构不能进行分包。法律规定，施工总承包的，建筑工程主体结构的施工必须由总承包单位自行完成。而且建设单位将基础工程单独分包的属于肢解发包，而法律又规定，发包人不得将应当由一个承包人完成的建设工程支解成若干部分发包给数个承包人。因此即使对基础和主体结构工程进行分包且签订分包合同了，也会因为合同违反法律规定而导致合同无效。

一、甲方可以分包吗？

一般来说，不合法。分包工程需要经过建设单位认可才能分包，但建设单位不能直接指定分包人。对于建设单位推荐的分包单位，总承包单位有权拒绝或者采用。《工程建设项目施工招标投标管理办法》规定“招标人不得直接指定分包人”。《房屋建筑和市政基础设施工程施工分包管理办法》规定“建设单位不得直接指定分包工程承包人”。合法的分包须满足以下几个条件：(1)分包必须取得发包人的同意;(2)分包只能是一次分包，即分包单位不得再将其承包的工程分包出去;(3)分包必须是分包给具备相应资质条件的单位;(4)总承包人可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位，但不得将主体工程分包出去。

二、工程施工协议包括哪些内容

工程施工协议包括内容有：

1、建设工程的范围；

2、建设工期；

3、中间交工项目的开工和竣工时间；

4、工程质量标准；

5、工程造价；

6、技术资料交付时间；

7、材料和设备的供应责任；

8、结算方式和支付方式；

9、竣工验收方法、程序和标准；

10．质量保证范围和期限；

11、相互合作条款；

12、违约责任条款。

根据《中华人民共和国建筑法》规定，建筑工程总承包单位可以将承包工程中的部分工程发包给具有相应资质条件的分包单位；但是，除总承包合同中约定的分包外，必须经建设单位认可。施工总承包的，建筑工程主体结构的施工必须由总承包单位自行完成。