一、工程款打到挂靠公司甲方有权控制吗

土建的承包人是以挂靠公司名义承包土建的，土建和水电安装的工程款都由甲方付至挂靠公司账户，再由挂靠公司付给你和土建，对吧。我注意到你和挂靠公司是有协议的，协议明确约定和土建付款比例相同，所以，你可以书面发函告知挂靠公司，水电安装工程款的付款已经逾期及逾期多少，请他们尽快按协议约定的时间和比例支付，如果发函无效果，只能通过起诉的方式。

二、什么是挂靠公司

挂靠公司是指依附于一个具有独立法人资格的单位，一般理解为单位或个人利用其他单位的名义或资质，以挂靠方的名义从事生产经营活动，并向挂靠方缴纳一定费用的行为。

三、挂靠公司的注意事项

挂靠公司经营，对于公司财务来说实际上是比较复杂的，主要复杂在税务处理上，因为增值税不仅仅有销售产生的销项税，而且有购进产生的进项税，同时还要考虑所得税问题。所以，作为你个人来讲：

1、要考虑承担应缴的增值税。

如果没有进项增值税票，可以协商支付*%的增值税给挂靠公司，就不需要再核算每单业务自己要交多少增值税了。

2、要考虑承担应缴的所得税。

当然可以协商，用费用票据抵消利润，从而不须缴纳企业所得税。

3、资金分开使用很容易：另外开设一个结算帐号，自己控制私人印鉴。

4、挂靠协议对外的法律效力很低的，你最好以挂靠公司业务部门的形式出现，否则税务部门会认为挂靠公司有虚开增值税的行为，处罚很重的。

5.要公私分明。