一、二手商住两用房交易费用计算

1、个人所得税：

(1)差额征收：差额的20%：对于能提供合法、完整、准确的有关凭证，能够正确计算应缴纳税额的，将征收纳税所得额的20%，计征个人所得税;

(2)全额征收：全额的3%：不能提供合法、完整、准确的有关凭证，不能计算应缴纳额，比照《国家税务总局关于个人取得房屋拍卖收入征收个人所得税问题的批复》规定，统一按计税价格的3%计算缴纳个人所得税。

2、土地增值税：7%-9%

3、营业税：差额5.8%

4、房屋登记费：550元/套

5、土地证登记费：33~120

6、评估费：0.3%

7、印花税：0.05%(按正常交易价格计征)

8、交易手续费：11元/平米

9、契税：4%

二、商住两用房和普通住宅的区别

50年商住两用房产权住宅与普通住宅项目的不同，有以下四点主要区别：

1、未来使用费用不确定。前者如按公建用途规定，他的水、电、暖等使用费用都将采取商用价格。所以，对于购房者应该在购房时询问清楚。目前，开发商大多在前期开发中采取相应的补救措施，能按民用价格缴纳。

2、相关税费的差异。普通住宅项目初次购买和未来转让时契税为1.5%，而商住两用房50年产权的住宅，其契税按3%缴纳。

3、贷款条件的限制。购买此类房屋大多不能申请公积金贷款，但是也有少数项目在开发商的努力下能够办到。另50年产权或者40年产权的住宅，如采用银行贷款的方式，只能得到五成或六成按揭。

4、建设标准不同。如果按照公建相关要求，前者的人防和消防等建设标准较高，对开发商而言，成本将提高。