一、上海公租房申请在什么机构办理

上海市房屋管理局。

二、上海公租房申请办理依据

1、《公共租赁住房管理办法》(住房和城乡建设部令第11号)第八条规定，申请人应当根据市、县级人民政府住房保障主管部门的规定，提交申请材料，并对申请材料的真实性负责。申请人应当书面同意市、县级人民政府住房保障主管部门核实其申报信息。第九条规定，市、县级人民政府住房保障主管部门应当会同有关部门，对申请人提交的申请材料进行审核。

2、《本市发展公共租赁住房的实施意见》(沪府发〔2010〕32号)第三条第(二)款规定：严格申请和审核程序。申请对象主要向工作单位所在地的运营机构提出申请，也可以向本市户籍所在地的运营机构提出申请。申请对象应如实填报申请表，按要求提交户籍证明或居住证、身份证、劳动或工作合同、住房状况等资料，承诺对提交资料的真实有效性负责，经申请对象所在单位确认后，交运营机构审核。对审核通过的申请对象，运营机构应出具登记证明，报区(县)住房保障机构备案。

3、《关于本市廉租住房和公共租赁住房统筹建设、并轨运行、分类使用的实施意见》(沪府发〔2013〕57号)第二条第一款规定：公共租赁住房保障对象的申请受理和审核，由区(县)住房保障机构按照公共租赁住房相关规定实施。区(县)住房保障机构可在街道(乡镇)或公共租赁住房运营机构设立受理窗口，委托实施申请受理和审核工作。