农村集体土地被依法征收后，应由当地的市、县国土资源局支付土地补偿费。《中华人民共和国土地管理法》实施条例第25条明确规定：“市、县人民政府土地行政主管部门根据经批准的征用土地方案，会同有关部门拟订征地补偿、安置方案，在被征用土地所在地的乡（镇）、村予以公告，听取被征用土地的农村集体经济组织和农民的意见。征地补偿、安置方案报市、县人民政府批准后，由市、县人民政府土地行政主管部门组织实施。”及第26条：“土地补偿费归农村集体经济所有”的规定，土地补偿费的支付主体为市、县国土资源局，支付对象为农村集体经济组织。有的土地承包经营户要求当地政府或占地单位支付土地补偿费的要求是错误的，而且，应支付给农村集体经济组织。

征地补偿费如何管理

现实中很多征用土地的行为的程序虽然合法，但是在支付、管理征地补偿费的时候有履行瑕疵。

我国规定，市、县人民政府土地行政主管部门应在土地征用批准后三个月内，将征地补偿费用支付给被征用土地的农村集体组织或村民委员会。在完成了支付之后，补偿费用管理使用又成了问题，征地补偿费如何管理对于补偿费用的管理要分类讨论：

1、土地补偿费。由农村集体经济组织或者村民委员会管理，主要用于发展集体经济和改善生产和生活条件，可视土地使用者或者土地承包者对土地的投入情况给予适当补偿。

2、安置补助费。谁负责安置，谁管理、使用，不安置的支付给个人。

3、地上附着物补偿费。谁拆迁或迁建的，支付给谁；自行拆迁的，支付给附着物的所有者；林木、果树补偿给所有者。

4、青苗补偿费。青苗的补偿费支付给所有者。禁止侵占、挪用被征地单位征地补偿费和其他有关费用。

5、对征用承包户的土地补偿。征用农业承包户的土地，承包期限在10年以上的，农村集体经济组织和村民委员会可以将土地补偿费的80％支付给土地承包经营者。