工程质量不合格的有下列处理程序：

1、当工程质量出现问题时，监理工程师应首先判断其严重程度。可理通知可以通过维修或返工来弥补质量问题；

2、指示施工单位撰写质量问题调查报告，提出处理方案，填写监理通知回复表，报监理工程师审核；

3、批准承包商处理，必要时经建设单位和设计单位批准，处理结果重新验收。

谁应该承担工程质量不合格的违约责任

如工程未经竣工验收，交付使用后发现上述问题，由建设单位承担责任；如经过竣工验收后交付使用的，则通过竣工验收意味着建设单位对质量的认可，以后再发生非主体工程和地基基础工程的质量缺陷，施工方应承担保修责任而不用承担违约责任。但合同另有约定的除外，比如有的合同约定，承包人应该在工程保修期内承担工程质量担保责任等。

若验收合格后，出现质量问题，承包方提出是设计问题，《建筑法》第58条规定：“建筑施工企业对工程的施工质量负责。”第59条规定：“建筑施工企业必须按照工程设计要求、施工技术标准和合同的约定，对建筑材料、建筑构配件和设备进行检验，不合格的不得使用。”

据此，如果各方对质量问题是否在承包单位的保修范围内存在争议，可以由具备相应资质的鉴定单位进行鉴定，根据鉴定结论，由相关责任方承担相应的责任。

《中华人民共和国建筑法》第六十一条交付竣工验收的建筑工程，必须符合规定的建筑工程质量标准，有完整的工程技术经济资料和经签署的工程保修书，并具备国家规定的其他竣工条件。

建筑工程竣工经验收合格后，方可交付使用；未经验收或者验收不合格的，不得交付使用。