根据《国家税务总局关于贯彻落实企业所得税法若干税收问题的通知》第三条的规定：企业转让股权收入，应于转让协议生效、且完成股权变更手续时，确认收入的实现。转让股权收入扣除为取得该股权所发生的成本后，为股权转让所得。企业在计算股权转让所得时，不得扣除被投资企业未分配利润等股东留存收益中按该项股权所可能分配的金额。所以，股权转让所得并入当年应纳税所得额中，计算缴纳企业所得税。

一、公司将股权转让给公司股权转让涉及哪些税费

公司将股权转让给公司股权转让涉及到的税费有：

（一）企业所得税。企业所得税是对我国内资企业和经营单位的生产经营所得和其他所得征收的一种税。

（二）增值税。企业的股权转让，常常按金融商品转让征收增值税，据财税（2016）36号文规定：一般纳税人税率6％；小规模纳税人征收率3％。

（三）契税。根据规定，在股权转让中，单位、个人承受企业股权，企业的土地、房屋权属不发生转移，不征契税；在增资扩股中，对以土地、房屋权属作价入股或作为出资投入企业的，征收契税。

（四）印花税。印花税是对经济活动和经济交往中订立、领受具有法律效力的凭证的行为所征收的一种税。

二、上市公司股权转让有什么流程

上市公司股权转让流程如下：

（一）召开公司股东大会，研究股权出售和收购股权的可行性，分析出售和收购股权的目的是否符合公司的战略发展，并对收购方的经济实力经营能力进行分析，严格按照公司法的规定程序进行操作。

（二）出让和受让双方进行实质性的协商和谈判。

（三）出让方即国有、集体企业向上级主管部门提出股权转让申请，并经上级主管部门批准。

（四）评估、验资。出让的股权属于国有企业或国有独资有限公司的，需到国有资产部门进行立项、确认，然后再到资产评估事务所进行评估。其他类型企业可直接到会计事务所对变更后的资本进行验资。

（五）出让方召开职工大会或股东大会。集体企业性质的企业需召开职工大会或职工代表大会，按《工会法》条例形成职代会决议。有限公司性质需要召开股东大会，并形成股东大会决议。

（六）股权变动的公司需召开股东大会，并形成决议。

（七）出让方和受让方签定股权转让合同。

（八）由产权交易中心审理合同及其附件，并办理交割手续。

（九）到各有关部门办理变更、登记手续。