做胃镜农村合作医疗是否可以报销需要根据具体的情况来决定：

1．普通人群在门诊进行胃镜检查时，是不能够报销的。

2．在住院期间如果有检查指征，进行胃镜检查，可以进行医保报销。

3．对于患有胃癌、胃恶性淋巴瘤的人群，如果胃癌、胃恶性淋巴瘤等疾病在当地慢性病或者大病医疗保险范围内的，即使在门诊进行胃镜检查，也能够报销。

《社会保险法》第二十八条

符合基本医疗保险药品目录、诊疗项目、医疗服务设施标准以及急诊、抢救的医疗费用，按照国家规定从基本医疗保险基金中支付。

第二十九条

参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。

社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。