1、对非保税区运往保税区的货物不予退（免）税，保税区内企业从区外购进货物时必须向税务机关申报备案增值税专用发票的有关内容，将这部分货物出口或加工后再出口的，可按本规定办理出口退（免）税。

（财税字[1995]92号）

2、保税区内生产企业从区外有进出口经营权的企业购进原材料、零部件等加工成产品出口的，可按保税区海关出具的出境备案清单以及其他规定的凭证，向税务机关申请办理免、抵、退税。

保税区内进料加工企业从境外进口料件，可凭保税区海关签发的海关保税区进境货物备案清单办理《生产企业进料加工贸易免税证明》等单证。

（国税发[2003]139号）

3、保税区外的出口企业销售给外商的出口货物，如外商将货物存放在保税区内的仓储企业，离境时由仓储企业办理报关手续的，保税区外的出口企业可凭货物进入保税区的出口货物报关单（出口退税专用联）、仓储企业的出口备案清单及其他规定的凭证，向税务机关申请办理退税。保税区海关须在上述货物全部离境后，方可签发货物进入保税区的出口货物报关单（出口退税专用联）。

4、保税区外的出口企业开展加工贸易,若进口料件是从保税区内企业购进的,可按现行的进料加工和来料加工税收政策执行。

（国税发[2000]165号）。