税务部门计算车辆购置税时，一般是按发票价格进行计算的，但发票价格低于最低计税价格时，按最低计税价格计税。

《中华人民共和国车辆购置税法》

第六条应税车辆的计税价格，按照下列规定确定：

(一)纳税人购买自用应税车辆的计税价格，为纳税人实际支付给销售者的全部价款，不包括增值税税款；

(二)纳税人进口自用应税车辆的计税价格，为关税完税价格加上关税和消费税；

(三)纳税人自产自用应税车辆的计税价格，按照纳税人生产的同类应税车辆的销售价格确定，不包括增值税税款；

(四)纳税人以受赠、获奖或者其他方式取得自用应税车辆的计税价格，按照购置应税车辆时相关凭证载明的价格确定，不包括增值税税款。