若员工察觉单位存在违法补缴公积金的行为，其权益将得到以下程度的保障：首先，应前往市公积金管理中心以及各区县管理部门进行投诉与举报，而非直接向劳动仲裁委员会发起劳动仲裁申请。其次，倘若单位在规定期限内未能足额或全额缴纳住房公积金，则住房公积金管理中心有权发出限期缴存通知；如若逾期仍未履行缴存义务，则可依法申请人民法院强制执行。

《住房公积金管理条例》第三十八条

违反本条例的规定，单位逾期不缴或者少缴住房公积金的，由住房公积金管理中心责令限期缴存；

逾期仍不缴存的，可以申请人民法院强制执行。