农村医疗合作，在一般情况下都可以进行报销。

但是以下5种情况不能报销：

1、非正常转诊到上级医院。

2、非因疾病产生的费用。

3、非因自身原因产生的费用。

4、违法行为导致自身受伤。

5、超过最后报销期限的。

《社会保险法》第二十四条

国家建立和完善新型农村合作医疗制度。

新型农村合作医疗的管理办法，由国务院规定。

第二十五条

国家建立和完善城镇居民基本医疗保险制度。

城镇居民基本医疗保险实行个人缴费和政府补贴相结合。

享受最低生活保障的人、丧失劳动能力的残疾人、低收入家庭六十周岁以上的老年人和未成年人等所需个人缴费部分，由政府给予补贴。