一、购房合同中的补充协议是否有效

1、购房合同中的补充协议是有效的。但是前提必须是存在合法有效的购房合同，也就是存在主合同，如果没有主合同情况之下，那么补充协议自然而然是没有法律效力的。

2、并且补充协议也必须符合法律规定。

3、法律依据：《民法典》第五百一十条

【合同没有约定或者约定不明的补救措施】合同生效后，当事人就质量、价款或者报酬、履行地点等内容没有约定或者约定不明确的，可以协议补充;不能达成补充协议的，按照合同相关条款或者交易习惯确定。

二、购房合同中的注意事项是什么

1、出卖人已向买受人说明：层高为设计标准层层高，非楼层净高，不同空间和部位的层高会因设计、施工不同而不同。买受人对此已充分理解，并不持异议而愿意接受。

2、该商品房朝向以红线图朝向标准为准;阳台个数及封闭状况以规划部门批准单体方案为准。

3、买受人在认购本合同项下的商品房时已被告知，本条中约定的房产测绘机构可能因故发生变更，对此买受人不持异议。如发生上诉变更，出卖人不再另行通知。