公安机关调查行政案件的时候，终止调查的情形包括没有违法事实的、违法行为已过追究时效、违法嫌疑人死亡的等。

相关法律规定

《公安机关办理行政案件程序规定》

第二百五十九条经过调查，发现行政案件有下列情形之一的，经公安派出所或者县级公安机关办案部门以上负责人批准，终止调查:

(一)没有违法事实的；

(二)违法行为已过追究时效的；

(三)违法嫌疑人死亡的；

(四)其他需要终止调查的情形。

公安机关终止调查时，违法嫌疑人已被采取行政强制措施的，应当立即解除。

第二百六十条公安机关对在办理行政案件过程中形成的文书材料，应当按照一案一卷原则建立案卷，并按照有关规定在结案或者终止案件调查后将案卷移交档案部门保管或者自行保管。