一、存根联怎么保管

1、存根联应当由开具发票的单位和个人保存5年，不得擅自损毁。保存期满，报经税务机关查验后销毁。存根联是票据凭证的一种，属于原始凭证(自己知道记账凭证)，与票据联、抵消联、记账联组合成四联票据。

2、法律依据：

根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十七条

开具发票的单位和个人应当建立发票使用登记制度，设置发票登记簿，并定期向主管税务机关报告发票使用情况。

第二十九条

开具发票的单位和个人应当按照税务机关的规定存放和保管发票，不得擅自损毁。已经开具的发票存根联和发票登记簿，应当保存5年。保存期满，报经税务机关查验后销毁。

二、发票存根联保存期限有几年

1、五年。“已经开具的发票存根联和发票登记簿，应当保存五年。保存期满，报经地税机关查验后，按照核销的程序进行销毁。请注意：“保存期满，报经地税机关查验后，按照核销的程序进行销毁。”这句话，如果报税务机关查验，而税务机关未能查验或不置可否，那就只能无限期保存了

2、账簿、记账凭证、报表、完税凭证、发票、出口凭证以及其他有关涉税资料应当合法、真实、完整。账簿、记账凭证、报表、完税凭证、发票、出口凭证以及其他有关涉税资料应当保存10年;但是，法律、行政法规另有规定的除外。