工程建设合同纠纷可以仲裁。根据规定：平等主体的公民、法人和其他组织之间发生的合同纠纷和其他财产权益纠纷，可以仲裁。建设工程合同纠纷适用仲裁。但是需要事先在合同里约定相应的仲裁条款，在约定仲裁条款时需要注意以下内容：第一，仲裁条款必须以书面形式表示。是双方同意将可能发生的纠纷提交仲裁的意思表示。第二，仲裁条款的内容必须符合法律规定。第三，仲裁条款必须无法定的无效情形。

一、买卖合同纠纷能否起诉？

买卖合同纠纷如果合同当事人没有订立仲裁协议或者仲裁协议无效的，可以向人民法院起诉。买卖合同纠纷如果有约定的仲裁条款并且有效,只能向仲裁申请。一种例外合同一方当事人向法院起诉时未声明有仲裁条款，另一方当事人在首次开庭前也未对人民法院受理该案件提出异议的,视为放弃原先订立的仲裁协议，人民法院可以受理起诉。

二、合同纠纷的处理方式

合同纠纷有几种解决纠纷的方法：1、协商。双方通过友好协商解决争端。这是最好的方法；2、调解。如果双方无法通过协商达成协议，则可以要求相应机构进行调解。3、仲裁。当事人不协商，不愿调解的，可以按照约定的仲裁条款或者发生纠纷后双方达成的仲裁协议，向仲裁机构请求仲裁；4、诉讼。如果没有仲裁条款，而以后又未达成仲裁协议，则的当事方可以在法庭上起诉纠纷，以达成和解。