一、建筑工程合同纠纷如何分配纠纷中的举证责任

建筑工程合同纠纷分配纠纷中的举证责任的方式是以“谁主张谁举证”为原则，以举证责任倒置为例外。

《民事诉讼法》第六十四条：当事人对自己提出的主张，有责任提供证据。当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。人民法院应当按照法定程序，全面地、客观地审查核实证据。

二、建筑工程合同纠纷的特点

建筑工程合同纠纷的特点如下：

1.法律关系比较复杂。

2.对于法官和律师专业性要求非常高。

3.证据繁多。因为是建筑工程合同纠纷，证据往往避免不了招投标文书、施工合同、监理日志、施工日志、索赔和签证函、会议纪要等等。

4.标的额相对比较大，这点无需再作阐述。

三、如何处理建筑工程合同纠纷,

1.严格招投标和承发包程序，优选施工单位，严格控制工程分包和转包。

2.建设前期加强立项管理，打足投资，保证归口使用资金80%以上存入银行，专款专用。

3.加强合同和信息管理，签定协议尽量采用规范的合同示范文本，对附加条款要仔细推敲，咨询有关专家，请专家给予指导。

4.严格进行工程变更把关，严禁通过设计变更扩大建设规模，增加工程内容，提高建设标准，对必须变更的，应先做工程量和造价增减分析。

5.加强隐蔽工程的检查验收，完善隐蔽工程现场签证手续。

6.及时解决工程中的索赔问题。

7.结算时，力争不漏算，不错套定额，不乱取费，并委托具有资质的造价咨询机构进行结算、委托资深望重的造价工程师主持结算工作。

8.进一步规范业主、承包商、政府行政管理部门的行为，不瞎指挥。