特许经营合同的核心是无形资产的使用，其中对经营诀窍、技术机密等的保密问题十分重要。因此特许经营合同都有保密条款。如某特许经营合同规定：“乙方（被特许人）及加盟店应将《手册》及为履行本合同所制定或批准的其他资料所含内容列为机密，并使其处于保密状态。未经甲方（特许人）事先书面同意，乙方及加盟店不得复制、记录或以其他方式泄露给他人。乙方及加盟店承诺在整个合同期内和合同期满后十年内，不将其所知悉的任何保密的知识、经营方法等向其他个人、组织、公司透露。

特许经营最大的弱点就是容易制造出业务的竞争者，为了防止被特许者学到企业的经营诀窍和技术机密后独立开展特许经营业务，特许人往往在特许经营合同中规定限制竞争条款。

一、特许经营与直营连锁、自由连锁的区别

从特许经营、直营连锁、自由连锁各自的定义和特征可以看出，特许经营与直营连锁和自由连锁都有比较明显的区别。

（一）特许经营与直营连锁的区别

1、产权关系不同。

特许经营是独立主体之间的合同关系，各个特许加盟店的资本是相互独立的，与总部之间没有资产纽带；而直营连锁店都属于同一资本所有，各个连锁店由总部所有并直接运营、集中管理。这是特许经营与直营连锁最本质的区别。特许经营总部由于利用他人的资金迅速扩大产品的市场占有率，所需资金较少。相比之下，直营连锁的发展更易受到资金和人员的限制。

2、法律关系不同。

特许经营中特许人（总部）和被特许人（加盟店）之间的关系是合同关系，双方通过订立特许经营合同建立起关系，并通过合同明确各自的权利和义务。而直营连锁中总部与分店之间的关系则由内部管理制度进行调整。

3、管理模式不同。

特许经营的核心是特许经营权的转让，特许人（总部）是转让方，被特许人（加盟店）是接受方，特许经营体系是通过特许者与被特许者签订特许经营合同形成的。各个加盟店的人事和财务关系相互独立，特许人无权进行干涉。而在直营连锁经营中，总部对各分店拥有所有权，对分店经营中的各项具体事务均有决定权，分店经理作为总部的一名雇员，完全按总部意志行事。

4、涉及的经营领域不完全相同。

直营连锁的范围一般限于商业和服务业，而特许经营的范围则宽广得多，除商业、零售业、服务业、餐饮业、制造业、高科技信息产业等领域外，在制造业也被广泛应用。

（二）特许经营与自由连锁的区别

1、特许经营是总部和加盟店依照一对一的特许经营合同成立的，而自由连锁是加盟店自发、自愿共同结成的组织。

2、特许经营的加盟店与总部之间存在纵向关系，各加盟店没有横向联系。自由连锁的加盟店之间则存在横向联系。

3、自由连锁是由加盟店集资组成，所以加盟店可以得到由总部利润中作为战略性投资的、持续性的利润返还，而特许经营中没有这种总部对加盟店的利润返还机制。

4、自由连锁成员店的经营自主权比特许经营加盟店多，相互联系更为松散。

5、特许经营加盟店在合同期内不能自由退出，自由连锁店可以自由退出。

6、自由连锁总部一般是非营利性机构，不收或收取少量的会费。特许经营中则有特许经营费用和保证金等。

7、特许经营体系通常依托于特许人开发的某些独特的产品、服务、经营方法、商号、商誉或者专利之上，而自由连锁则没有这些特点。

二、特许加盟店协议合同转让有何效力

特许加盟店协议合同转让未经特许人同意的，合同转让无效；特许人同意转让的，合同转让有效。

根据《商业特许经营管理条例》第十八条规定，未经特许人同意，被特许人不得向他人转让特许经营权。

被特许人不得向他人泄露或者允许他人使用其所掌握的特许人的商业秘密。

《民法典》第五百五十五条规定，当事人一方经对方同意，可以将自己在合同中的权利和义务一并转让给第三人。