进行司法鉴定时，应该由双方当事人协商确定具备资格的鉴定人，如果单方委托的，另一方可以对鉴定结果提出异议，异议成立的鉴定结论是不具有法律效力的。

一、民法典中对医疗纠纷处理

第一，发生医疗纠纷后，首先医患双方可以进行协商调解，达成协议，纠纷处理结束。第二，如果双方协商不成，医患任何一方均可向主管卫生行政部门提出处理请求。请求进行医学鉴定，根据鉴定结果，协调双方承担相应责任。达成调解协议，纠纷处理结束。第三，如果不服协调，可以向法院提起诉讼，也可以跳过第一、第二，直接向法院起诉。法院会根据案情，委托鉴定机构进行司法鉴定。并根据鉴定结果，做出依法判决。如果有其他不明白的，可以继续追问的。

二、伤残鉴定怎么鉴定

根据我国相关法律规定，其伤残鉴定为：

当事人委托司法鉴定机构和社会专业司法鉴定人进行伤残鉴定。在司法鉴定机构在收到委托人的委托书后，应当对委托人的委托事项进行审核，并作出是否受理的决定。在鉴定机构受理案件后，应当指派具有司法鉴定资格的人员承担鉴定工作，同一个鉴定事项应当由两名具有社会专业司法鉴定资格的人员进行对委托人的鉴定。其司法鉴定机构接受委托进行补充鉴定，应当对委托人请求的事项进行相应的审查。