医保卡当年余额和历年余额的区别有：

1、当年余额是指医保卡个人账户在当年一年中所剩的余额，历年余额是指个人账户中之前几年累计起来所剩的余额。

2、当年余额可以用来支付门诊、急诊、院前急救、定点零售药店购药的费用，历年余额除了支付门诊、急诊等费用，还可以支付定点医疗药店买药的费用。

怎么查医保卡余额？

在网上搜索“医保卡余额查询”，进入“12333”社保查询的网站，在医保信息查询网，输入自己的身份证号，登录密码和验证码，即可登录系统查询自己的医保卡余额。也可以在当地的医保定点的药店，请工作人员帮助刷卡查询。

《中华人民共和国社会保险法》第二十九条

参保人员医疗费用中应当由基本医疗保险基金支付的部分，由社会保险经办机构与医疗机构、药品经营单位直接结算。社会保险行政部门和卫生行政部门应当建立异地就医医疗费用结算制度，方便参保人员享受基本医疗保险待遇。