农村办理房产证通常是不存在弊端的情况，而且拥有了农村房产证，在城市购房也没有影响，因为法律规定农村居民可以拥有一处宅基地，但并没有规定不能拥有多处房产，因此在城市进行买房也不影响村民取得宅基地的使用权。

农村房产证的补办流程

农村房屋产权证遗失和其他房权证一样办理，如下：

1、若发现房权证丢失，马上带着身份证明到房管部门档案室查取档案。

2、带着身份证明和复印的档案材料到当地报社发丢失声明，并保留登载声明的材料。

3、三个月（有时需6个月）后带着登载丢失声明的材料和身份证明到房管部门填写房权证申请审批表，申请补发。

4、房管部门受理后依法公示，若无人对该房屋主张权利的话则进入审批程序。

5、7个工作日后，带着身份证到房管部门，缴纳工本费后，就可以领取补发的房权证了。

《中华人民共和国城市房地产管理法》

第六十一条以出让或者划拨方式取得土地使用权，应当向县级以上地方人民政府土地管理部门申请登记，经县级以上地方人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府颁发土地使用权证书。

在依法取得的房地产开发用地上建成房屋的，应当凭土地使用权证书向县级以上地方人民政府房产管理部门申请登记，由县级以上地方人民政府房产管理部门核实并颁发房屋所有权证书。

房地产转让或者变更时，应当向县级以上地方人民政府房产管理部门申请房产变更登记，并凭变更后的房屋所有权证书向同级人民政府土地管理部门申请土地使用权变更登记，经同级人民政府土地管理部门核实，由同级人民政府更换或者更改土地使用权证书。

法律另有规定的，依照有关法律的规定办理。

第六十二条房地产抵押时，应当向县级以上地方人民政府规定的部门办理抵押登记。

因处分抵押房地产而取得土地使用权和房屋所有权的，应当依照本章规定办理过户登记。