两份合同不同，根据有效的判断。具体有：

1、如果两份合同的签订时间有顺序，且两份合同均为有效合同，除当事人有特别约定外，前后两份合同对同一内容有不同约定时，可根据意思表示最新最近，不违反合同目的，以合同成立时间顺序和后一份合同确定的内容为准。如果前后合同约定的内容不冲突，只是对合同内容有不同的约定，则不能简单地认定后一协议是前一协议的变更，或者后一协议是前一协议的补充和完善；

2、如果签订时间相同的合同，需要根据双方签订本合同的目的和实际履行情况确认双方实际履行的合同，一般以实际履行的合同为准。当事人可以通过和解或者调解解决合同纠纷。当事人未签订仲裁协议或者仲裁协议无效的，可以向人民法院起诉。

施工合同名称与备案工程名称不一致可以变更合同内容吗

施工合同名称与备案工程名称不一致可以变更合同内容，但变更合同内容需要双方协商一致。

《中华人民共和国民法典》

第五百四十三条【协议变更合同】当事人协商一致，可以变更合同。

第五百四十四条【变更不明确推定为未变更】当事人对合同变更的内容约定不明确的，推定为未变更。

《中华人民共和国民法典》第五百三十三条合同成立后，合同的基础条件发生了当事人在订立合同时无法预见的、不属于商业风险的重大变化，继续履行合同对于当事人一方明显不公平的，受不利影响的当事人可以与对方重新协商；在合理期限内协商不成的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构变更或者解除合同。

人民法院或者仲裁机构应当结合案件的实际情况，根据公平原则变更或者解除合同。