分公司能开增值税专用发票。但是必须取得营业执照以及国、地税务登记证。分公司在进行了税务登记后，可以向税务局申领发票。增值税纳税人一般是指，已办理税务登记的小规模纳税人，以及国家税务总局确定的其他可予代开增值税专用发票的纳税人。增值税纳税人发生增值税应税行为、需要开具专用发票时，可向其主管税务机关申请代开。

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凡是已经认定为是普通纳税人的企业，必须要通过防伪税控系统开具增值税专用发票。如果不是防伪税控系统开具的增值税专用发票，是不可以申报进项税额抵扣的。普通纳税人在正常的经营中没有规定增值税专用发票的使用期限，但是已经被取消一般纳税人资格的纳税人，必须要及时缴纳并注销，包括空白的专用发票和专用发票的存根。

《税务机关代开增值税专用发票管理办法（试行）》第五条本办法所称增值税纳税人是指已办理税务登记的小规模纳税人（包括个体经营者）以及国家税务总局确定的其他可予代开增值税专用发票的纳税人。

《税务机关代开增值税专用发票管理办法（试行）》第六条增值税纳税人发生增值税应税行为、需要开具专用发票时，可向其主管税务机关申请代开。