土地管理法规定和农村宅基地管理办法规定，宅基地确权一般是由乡土地所或者县土地管理局土地来管理的。我国的农村宅基通常还要让村上批，乡里备案。如果宅基地发生了纠纷，那么就是由乡级、县级经管站来负责仲裁处理。如果当事人一方对仲裁不服，那么可以向基层人民法院提起民事诉讼。

宅基地如何确权

（一）《村镇建房用地管理条例》公布之前建房使用的宅基地，超过规定的面积的也可维持现状。但在此之后拆迁、改建、翻建房屋，要严格按当地政府规定的面积标准审批。

（二）《村镇建房用地管理条例》公布以后到《土地管理法》实施时止，宅基地超面积的，要经地方人民政府依照国家政策处理后，再行确权。

（三）符合规定分户建房标准，未分户，现宅基地不超过合计面积的，不作为超面积处理。

（四）城市居民原在农村的房屋产权没有变化的则维持现状。

（五）继承房屋取得的宅基地，使合计面积超过政府规定标准的，要先按规定处理后再确权。

（六）华侨在农村的房屋由他人代管的，土地使用权可暂时确定给代管人，以后房屋退还华侨时，再变更土地使用权。

（七）已经确权的宅基地，在以后房屋拆迁、改建、翻建时，按政府规定的面积标准重新确定使用权。

（八）新《土地管理法》施行后，规定农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省规定的标准，违反本规定的不予确权。三、宅基地确权怎么个确法。

依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。

《中华人民共和国土地管理法》第六十二条规定，农村村民一户只能拥有一处宅基地，其宅基地的面积不得超过省、自治区、直辖市规定的标准。

农村村民建住宅，应当符合乡（镇）土地利用总体规划，并尽量使用原有的宅基地和村内空闲地。

农村村民住宅用地，经乡（镇）人民政府审核，由县级人民政府批准；其中，涉及占用农用地的，依照本法第四十四条的规定办理审批手续。

农村村民出卖、出租住房后，再申请宅基地的，不予批准。以上就是有关农村宅基地归哪个部门管的相关情况。