对于行政诉讼中发现被告主体具有不适格的情形，则处理办法如下：人民法院应当告知原告变更被告；原告不同意变更的，裁定驳回起诉。应当追加被告而原告不同意追加的，人民法院应当通知其以第三人的身份参加诉讼，但行政复议机关作共同被告的除外。

行政诉讼被告主体如何确定

（一）直接向法院起诉和经过行政复议以后向法院起诉被告的确定。直接起诉的行政讼讼案件的被告是作出具体行政行为的行政机关。经复议的案件，复议机关决定维持原具体行政行为的，作出原具体行政行为的行政机关是被告；复议机关改变原具体行政行为的，复议机关是被告。（二）共同行政行为中被告的确定。两个以上行政机关作出同一具体行政行为的，共同作出具体行政行为的行政机关是共同被告。（三）行政授权关系中被告的确定。由法律、法规授权的组织所作的具体行政行为，该组织是被告。（四）行政委托关系中被告的确定。由行政机关委托的组织所作出的具体行政行为，委托的行政机关是被告。（五）行政机关被撤销后被告的确定。行政机关被撤销的，继续行使其职权的行政机关是被告。

《最高人民法院关于适用的解释》第二十六条

原告所起诉的被告不适格，人民法院应当告知原告变更被告；原告不同意变更的，裁定驳回起诉。

应当追加被告而原告不同意追加的，人民法院应当通知其以第三人的身份参加诉讼，但行政复议机关作共同被告的除外。

第二十八条

人民法院追加共同诉讼的当事人时，应当通知其他当事人。应当追加的原告，已明确表示放弃实体权利的，可不予追加；既不愿意参加诉讼，又不放弃实体权利的，应追加为第三人，其不参加诉讼，不能阻碍人民法院对案件的审理和裁判。