拆迁厂房的赔偿包括：替代土地的价差损失；经营损失，停业停产损失；地上物，即房屋、机器设备等固定资产的损失；搬迁费用；解聘员工的安置补偿费用等。

一、个人独资企业拆迁补偿标准

个人独资企业拆迁没有单独的补偿标准。根据房产证上的厂房面积和土地证上的土地面积，按照市场评估价进行拆迁补偿。被拆迁资产的补偿费用包括：不能搬迁的土地、房屋、建筑物和地上附着物的补偿，因搬迁而损失的机器设备的补偿等；停产停业的损失视实际情况而定，一般包括实际损失和预计损失；拆迁补偿费包括搬迁前期费用、搬迁期间停工费用、机械设备调试修理费用、材料拆除、包装、运输费用、辞退职工补偿费等；根据拆迁政策，奖励费包括快迁费、拆迁奖励费等。

三、自家宅院办企业拆迁有补偿吗

通常情况下，自家宅院办企业拆迁有补偿。补偿费用有：1、被征收固定资产价值的补偿费用。无法搬迁的土地、房屋、厂房、办公楼等建筑物和地上附着物，确实由于搬迁导致损失的机器设备而生的补偿；2、由于征收造成的搬迁和临时安置补偿费用；3、停产停业损失补偿费用，按实际情况来定；4、由于拆迁政策发生的奖励费用。