用人单位可以依据本公司的规章制度，以员工旷工为由扣员工工资，但是不能随便扣，如果是处罚过度的话可以向劳动监察大队投诉的。

《劳动部关于印发工资支付暂行规定通知》第十五条

可以扣工资的情形有：

（1）用人单位代扣代缴的个人所得税；

（2）用人单位代扣代缴的应由劳动者个人负担的各项社会保险费用；

（3）法院判决、裁定中要求代扣的抚养费、赡养费；

（4）法律、法规规定可以从劳动者工资中扣除的其他费用。