1、性质不同

辞职是劳动者向用人单位提出解除劳动合同或劳动关系的行为；而自离是职工根据企业和自身情况擅自离职，而强行解除与企业的劳动关系的一种行为。

2、待遇不同

辞职是双方协商解除劳动合同。因为合同期未满，一般由劳动方提出解除合同申请，用工方同意后，视为协商解除劳动合同，用工方要给付劳动方应得的劳动报酬及其它权益。

自离是劳动方未与用工方协商，单方面解除劳动合同，不仅不能得到应得的劳动报酬，还有可能遭用工方追诉违约损失。

3、主体不同

解除劳动合同的运用主体可以是用人单位，也可以是劳动者。而辞职、自动离职的运用主体只是劳动者。

一、用人单位不签订劳动合同劳动者怎么办

如果用人单位不与劳动者签订劳动合同，劳动者在劳动关系存续期间，应注意搜集并保存双方成立劳动关系的有关证据，比如：

1、用人单位招聘时要求劳动者填写的报名表、登记表等招用记录。

2、用人单位收取劳动者押金或扣押劳动者工资而出具的押金条、扣押条等各种票据。

3、用人单位给劳动者发放的工作证、服务证、门卡等各种工作证件。

4、用人单位给劳动者发放的工资卡或其他工资支付凭证。

5、用人单位给劳动者发放的工作服、饭卡等与用人单位有关的东西。

5、职工的工资表、考勤记录、值班表、任命书、解除合同通知书、辞退通知书等各种加盖有用人单位公章的文件。

二、劳动合同解除的方式

1、法定解除。

法定解除是指在履行合同过程中出现法定解除合同情形，当事人有权解除合同。

2、约定解除。

约定解除是指在合同中约定解除合同的事项，待约定的事由出现时，当事人有权解除合同。我国法律规定：当事人可以约定解除合同的条件，解除合同的条件成就时，解除权人可以解除合同。在发生了劳动合同约定的解除合同的条件以后，享有解除权一方的劳动者作出解除合同的意思表示后，劳动合同的权利义务即告终止，无须获得用人单位同意。

3、协商解除。

协商解除是指劳动合同履行过程中，当事人经协商一致同意解除合同。