在经济案件证据不足的情况下，法院应当根据疑罪从无的原则，如果证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。检察院可以退回公安机关补充侦查，也可以自行侦查。但在法院审判时发现经济案件证据不足，不能认定被告人有罪的，应当作出证据不足、指控的犯罪不能成立的无罪判决。因此，经济案件证据不足的案件应该进行补充侦查，或者由检察院自行侦查，并在一个月之内补充侦查完毕。