经济犯罪案件进行侦查时，可以收集的证据包括物证、书证、证人证言、电子数据等。根据《中华人民共和国刑事诉讼法》第五十条，可以用于证明案件事实的材料都是证据。这些证据包括物证、书证、证人证言、被害人陈述、犯罪嫌疑人、被告人供述和辩解、鉴定意见、勘验、检查、辨认、侦查实验等笔录以及视听资料和电子数据。证据必须经过查证属实，才能作为定案的根据。

经济纠纷是指平等主体之间发生的，以经济权利义务为内容的社会纠纷。经济纠纷有两大类：一是经济合同纠纷，如买卖合同纠纷、借款合同纠纷、承揽合同纠纷、建设工程合同纠纷、技术合同纠纷等；二是经济侵权纠纷，如知识产权（如专利权、商标权）侵权纠纷、所有权侵权纠纷、经营权侵权纠纷等。在市场经济中，合同是平等的市场主体间确立交易关系，共同实施交易行为，追求和实现经济目的的法定和普遍的形式，因此，合同纠纷是经济纠纷的主要部分。