1、股权转让双方之间的纠纷应列合同的相对人为被告，涉及到公司利益的，应列公司为第三人。

2、涉及其他股东优先购买权的诉讼纠纷应列出让股权的股东为被告，公司为第三人，涉及其他的股东利益，一并追加为第三人。

3、瑕疵出资股权转让引起的纠纷若是股权受让方明知出让方出资存在瑕疵仍受让的，对未按期足额的欠缴出资部分，债权人或者公司有权将股权受让方列为被告，要求承担连带补充责任。若受让方不知情，不应承担责任，还可以将股权转让方列为被告，要求撤销转让合同。

4、隐名股东或实际出资人转让股权引起的纠纷案件涉及到隐名股东与显名股东纠纷时，一般应将显名股东列为被告;涉及到隐名股东要求显名时，将公司列为被告;涉及到与第三人时，第三人与显名股东的纠纷，将显名股东与公司列为共同被告。第三人与隐名股东，第三人应将隐名股东列为被告。

一、股权转让纠纷应该如何处理

处理股权转让纠纷的方法有以下几种：

1、有限责任公司股东转让股权的，应当将拟受让人和拟转让价格条件告知公司及其他股东，并征求其是否同意转让的意见。

公司和其他股东应当在30日内答复，逾期不答复的，视为同意转让；公司和其他股东再次起诉撤销转让的，人民法院不予支持。

2、有限责任公司股东未足额出资的，转让股权。公司或者其他股东要求转让人用转让股权价款补足出资的，人民法院应当予以支持，可以增加受让人为第三人参加诉讼。

有限责任公司股东未足额出资转让股权的，受让人以转让标的有瑕疵或者被欺诈为由主张撤销合同的，人民法院不予支持，有法律规定的特殊情形除外。

3、名义股东未经实际出资人同意转让股权的，人民法院应当支持实际出资人要求名义股东赔偿因股权转让造成的损失。

二、股权转让合同纠纷怎么解决？

股权转让合同纠纷可以分为以下两个方面：一、向股东以外的人转让股权没有征得其他股东同意的处理未依法征得其他股东同意而转让股权的行为，严格讲是处于效力待定状态，如果其他股东追认的，则转让仍为有效。此种情形下，纠纷一般有两类：(1)股权转让合同成立后，尚未履行或尚未履行完毕，而受让人起诉出让人，要求其继续履行合同。(2)公司要求确认股东出让的股权无效。二、股权出让人是实际投资未到位者或抽逃投资者的处理在此情形下的纠纷，一般也存在两类。一为股权受让人以出让人欺诈为由，要求撤销股权转让合同或确认其为无效;二为公司债权人发现注册资金未到位，而要求出让人、受让人对公司债务承担责任，且前一纠纷往往因后一纠纷的发生而引发。在这类纠纷中，对于股权转让合同的效力，也不能一概认定为无效。审判实践中，应具体考察出让人对受让人是否构成欺诈来确定合同效力或是否属可撤销合同。