公司的股权纠纷的处理方法如下：

1、股权转让双方之间的纠纷应列合同的相对人为被告，涉及到公司利益的，应列公司为第三人；

2、涉及其他股东优先购买权的诉讼纠纷应列出让股权的股东为被告，公司为第三人，涉及其他的股东利益，一并追加为第三人；

3、瑕疵出资股权转让引起的纠纷若是股权受让方明知出让方出资存在瑕疵仍受让的，对未按期足额的欠缴出资部分，债权人或者公司有权将股权受让方列为被告，要求承担连带补充责任。

发生股权纠纷应注意什么

股权纠纷，指公司、股东或其他人之间，在行使各种权力过程中，就各方权利义务关系产生的争议。

1、诉讼主体，凡是认为自己受到虚假陈述行为侵害并发生损失的投资人，均可向人民法院提起赔偿之诉，被告则为虚假陈述行为人。

2、不公开审理，涉及商业秘密的案件，当事人申请不公开审理的，可以不公开审理，但仍应公开宣告判决。

随着市场经济的健全与完善，人们在经济领域的交往与合作也日趋频繁，但是人们为了利益的争夺难免会发生股权转让纠纷、股东出资纠纷等，那若发生此类纠纷的话公司与股东之间的利益该如何平衡呢这一问题不妨问问专业的律师，也可以请律师帮忙处理此类事宜。

《中华人民共和国民法典》第五百三十三条合同成立后，合同的基础条件发生了当事人在订立合同时无法预见的、不属于商业风险的重大变化，继续履行合同对于当事人一方明显不公平的，受不利影响的当事人可以与对方重新协商；在合理期限内协商不成的，当事人可以请求人民法院或者仲裁机构变更或者解除合同。

人民法院或者仲裁机构应当结合案件的实际情况，根据公平原则变更或者解除合同。