农村拆迁补偿款纠纷处理流程是：

1、行政复议，认为行政主体的具体行政行为侵犯其合法权益，依法向法定的行政复议机关提出复议申请；

2、民事诉讼，可以起诉民事侵权，要求停止侵害、赔偿损失、恢复原状；

3、协调裁决，由县级以上地方人民政府协调；协调不成的，由批准征用土地的人民政府裁决。

一、农民不同意征地怎么办

农民不同意征地的，可以要求举行听证会，对补偿标准有争议的，由县级以上人民政府协调；协调不成的，由批准征地的人民政府裁决，对作出的裁决可以依法申请复议一次，对复议决定不服的，既可以申请国务院作出最终裁决，也可以直接向人民法院提起行政诉讼。

二、检察院复议是什么意思

是指公民、法人或者其他组织不服行政主体作出的具体行政行为，认为行政主体的具体行政行为侵犯了其合法权益，依法向法定的行政复议机关提出复议申请，行政复议机关依法对该具体行政行为进行合法性、适当性审查，并作出行政复议决定的行政行为。

三、拆迁商铺纠纷如何办

1、行政裁决：经当事人申请，由县级以上地方人民政府房屋拆迁管理部门裁决。房屋拆迁管理部门是被拆迁人的，由同级人民政府裁决。裁决的内容应当包括补偿方式和补偿金额、安置用房面积和安置地点、搬迁期限、搬迁过渡方式和过渡期限等事项。裁决应当自收到申请之日起30日内作出。

2、依法起诉：若拆迁当事人对裁决不服，可以在接到裁决书之日起60日内向作出裁决的房屋拆迁管理部门的本级人民政府申请行政复议。也可以在接到裁决书之日起3个月内向人民法院起诉。

3、强制拆迁：如果被拆迁人或者房屋承租人拒绝执行房屋拆迁管理部门的裁决，在裁决规定的搬迁期内未搬迁的，可以依法实施强制拆迁，由房屋所在地市、县人民政府责成有关部门执行，或者由房屋拆迁管理部门申请人民法院执行。