根据相关法律条文和司法解释的规定，抵押后租赁房屋被法院拍卖的话，如果是抵押权设立前抵押财产已出租并转移占有的，原租赁关系不受该抵押权的影响。但是如果抵押权设立后，抵押人又将抵押财产出租的，该租赁关系不得对抗抵押权。该项制度的规定，有利于贯彻我国民法的公平原则，也是保障平等民事主体在民事活动中合法民事权益的具体体现之一。

办理房屋抵押注销后怎么办理房产证

一、借款人在贷款还清以后，先到贷款银行领取银行盖章的《房地产抵押注销申请表》、《公有（私有）房屋抵押权注销登记申请书》并由抵押人签字，以及《房屋他项权证》。

二、抵押人带上本人身份证件（抵押人或抵押权人为个人的）、《房地产抵押合同》（一份）、《房地产抵押权注销申请表》、《公有（私有）房屋抵押权注销登记申请书》、《房屋所有权证》、《国有土地使用证》、《房屋他项权证》，到房管局抵押登记受理窗口办理抵押注销手续。

三、抵押登记受理窗口的工作人员对抵押注销申请材料进行审核，材料无误后将在柜台当场办理注销手续．注销手续办理完毕后，将把《房屋所有权证》、《国有土地使用证》还给抵押人，其他注销材料由窗口的工作人员收存。

《中华人民共和国民法典》

第四百零五条抵押权设立前，抵押财产已经出租并转移占有的，原租赁关系不受该抵押权的影响。

第四百零六条抵押期间，抵押人可以转让抵押财产。当事人另有约定的，按照其约定。抵押财产转让的，抵押权不受影响。