关于如何查询商品房预售合同是否已经登记备案的方法有以下几种：

首先，您需要访问您购买商品房所在地区的住房保障与房产管理局官方网站，进入其主页后，找到并点击页面中的“商品房网上备案查询”图标。

然后，您需要在弹出窗口中输入房产代码以及购房人的身份证明文件号码等相关信息进行登录，此时即可实时在网络上查询到该预售合同的详细内容。

其次，您也可直接前往购买商品房所在地区的房管局，向工作人员咨询有关预售批准的具体情况。

最后，如果您对开发商所提供的《商品房预售许可证》存在疑问，也可以要求他们出示以供查验。

《城市商品房预售管理办法》第九条开发企业进行商品房预售，应当向承购人出示《商品房预售许可证》。售楼广告和说明书应当载明《商品房预售许可证》的批准文号。