独立核算的分公司需要合并。分公司虽然能够独立核算，但不能自负盈亏，因为依法设立的分公司不具有法人资格，不能独立承担民事责任。因此总公司合并的，分公司需要一同合并。

一、公司的债务能否由分公司承担

总公司的债务能够由分公司承担。根据公司法相关规定，公司可以设立分公司。设立分公司，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照。分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。因此，分公司作为总公司的一部分，其财产属于总公司资产的一部分，因此，总公司的债务可以用分公司的财产来承担。

二、分公司是否可以签订合同

分公司可以签订合同。公司依照法律规定设立分公司的，应当向公司登记机关申请登记，领取营业执照，但是分公司不具有法人资格，不能独立承担民事责任，其民事责任应当由总公司承担。因此分公司可以以自己的名义签订合同，只是不能独立承担民事责任，分公司签订合同后，所产生的民事责任应当由总公司承担。

三、分公司如何承担责任,分公司在案件纠纷中的诉讼地位

分公司不承担责任，其责任有总公司承担，因为分公司不具有独立的法人资格。分公司在案件纠纷中的诉讼地位是：依法设立并领取营业执照的分公司能够作为诉讼主体，参与民事诉讼。但分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。