单位的合同工是直接和单位建立劳动关系，和单位签订劳动合同的。而派遣工的劳动关系在派遣单位，是和派遣单位签订劳动合同之后安排在用工单位工作的。主要存在的区别在于出现工伤事故，解除劳动关系时有不同。依据《劳动合同法》第四十六条有下列情形之一的，用人单位应当向劳动者支付经济补偿：（一）劳动者依照本法第三十八条规定解除劳动合同的；（二）用人单位依照本法第三十六条规定向劳动者提出解除劳动合同并与劳动者协商一致解除劳动合同的；（三）用人单位依照本法第四十条规定解除劳动合同的；（四）用人单位依照本法第四十一条第一款规定解除劳动合同的；（五）除用人单位维持或者提高劳动合同约定条件续订劳动合同，劳动者不同意续订的情形外，依照本法第四十四条第一项规定终止固定期限劳动合同的；（六）依照本法第四十四条第四项、第五项规定终止劳动合同的；（七）法律、行政法规规定的其他情形。第四十七条经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。劳动者月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资三倍的，向其支付经济补偿的标准按职工月平均工资三倍的数额支付，向其支付经济补偿的年限最高不超过十二年。本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。第六十五条被派遣劳动者可以依照本法第三十六条、第三十八条的规定与劳务派遣单位解除劳动合同。被派遣劳动者有本法第三十九条和第四十条第一项、第二项规定情形的，用工单位可以将劳动者退回劳务派遣单位，劳务派遣单位依照本法有关规定，可以与劳动者解除劳动合同。
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根据对法律法规的理解，劳务派遣是被派遣劳动者由用人单位被派遣到用工单位，从事临时性、辅助性、替代性的工作，劳动者实际在用工单位中付出劳动力。在劳动派遣关系中，存在劳动合同和劳务派遣协议两份合同。而合同工是用人单位通过签订合同招收的短期性的工人，劳动者从事的工作性质不受到限制，劳动者对用人单位进行劳动力给付。
劳务派遣与合同工之间最大的区别在于，劳动者与谁建立了劳动关系。劳务派遣中，劳动者与派遣单位构成劳动关系。派遣单位将劳动者派向用工单位，用工单位向派遣单位付服务费，派遣单位向劳动者付报酬。合同工是劳动者与实际用工单位构成劳动关系，实际用工单位向劳动者付报酬。
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