如果单位在发放你的工资的时候扣除了你一定的比例的因你个人的原因造成的公司损失的话，单位的做的就是合法的。 1、如果单位扣除比例超过了本人当月工资的20%就不合法了，如果不是扣除的因你的原因造成的损失，也是不合理的。现在单位扣除了后，你拿到手的工资不应当低于最低工资标准，单位的做法也是不合法的。 2、你可以与单位解除劳动合同，但是如果是你主动提出辞职的，单位就不会给你支付经济补偿金的。 3、如果你又想解除劳动合同，又想拿到经济补偿金的话，你就只能依据其他的原因来解除合同，比如单位未给你购买基本养老保险等理由。建议你与单位协商解决，该报案的尽快报案处理。毕竟车辆被撬车内财产被盗这属于盗窃案，属于刑事犯罪了。
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劳动者因为本身过错，造成用人单位损失，用人单位可以依据劳动合同的约定和相关法律，要求劳动者赔偿部分损失。但赔偿损失每月从工资中扣除的额度，不超过当月应发工资的20%，扣除后的剩余工资不得低于当地最低工资标准。当月扣不完的，下月可以继续扣除，直至清偿完毕。
如果是所谓的扣除员工工资的百分之二十集中发放,就是违法的。但如果在劳动者因本人原因造成用人单位经济损失的，用人单位可以扣发劳动者工资，但不得超过当月工资的20%。
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