1、如果双方可以就孩子抚养协商一致，按照双方当事人的意思出具判决书；2、如果双方不能就孩子抚养协商一致，法院会按照一人抚养一个子女的原则进行判决；3、判决抚养的时候法院会参考孩子的年龄，性别等因素进行判决。

双方离婚有两个孩子怎么判

离婚有两个孩子的，孩子抚养权归属可以先由父母双方进行协商；协商不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。但是如果孩子已经年满八周岁的，人民法院在确定抚养权归属问题上应当尊重孩子的意愿。

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。