二手商铺买卖税费的计算包括3—5％的契税，20％财产转让所得的税率；个人购买不足2年的住房按照5％的征收率全额缴纳增值税，2年以上（含2年）的免征增值税；6元／平方米的房屋交易手续费以及80元的房屋产权登记费。

二手商铺买卖税费：

买家支付的税费

1、房地产交易手续费：3元／平方米。

2、房屋登记费：550元／本（每增加一本证书按每本10元收取工本费）。

3、权证印花税：5元／本。

4、印花税：房屋产价的0．05％。

5、契税：交易价（或评估价）3％。

卖家支付的税费

卖家出售的时候，商铺不论年限，都要交纳以下几种税费：

1、房地产交易手续费3元／平方米。

2、印花税：房屋产价的0．05％。3、土地增值税：

3、A、可提供上手购房发票的，土地增值税＝［转让收入－上手发票价（每年加计5％）－有关税金］适用税率。B、不能提供上手购房发票的，土地增值税＝（转让收入－转让收入90％）30％。

4、个人所得税：据实征收为（转让收入－房产原值－合理费用）20％，核定征收为转让收入7．5％20％。转让收入－房产原值－合理费用相当于个人净收入。

5、营业税及附加税：A、可提供上手购房发票的，为（转让收入－上手发票价）5．5％。B、不能提供上手发票的，为转让收入5．5％。C、税费为差额的5．56％

6、土地出让金：商业用途用房，按其网格点基准地价的35％计收；商业路线价区段路的商业临街宗地，加收路线价的10％；办公用途用房按其网格点基准地价的30％计收。

7、土地出让金契税：按本次征收土地出让金价款的3％征收。

《个人所得税法》第二条

财产转让所得。应纳个人所得税。

《契税暂行条例》第三条

契税税率为３—５％。契税的适用税率，由省、自治区、直辖市人民政府在前款规定的幅度内按照本地区的实际情况确定，并报财政部和国家税务总局备案。

第九条

纳税人应当自纳税义务发生之日起10日内，向土地、房屋所在地的契税征收机关办理纳税申报，并在契税征收机关核定的期限内缴纳税款。