这两份合同俗称“阴阳合同”。经过备案的合同往往在许多方面对施工方有利。如果有发生纠纷，特别是工程款纠纷时，施工方往往主张应当以经过中标备案的合同为依据。理由是依据最高人民法院《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第21条“当事人就同一建设工程另行订立的建设工程施工合同与经过备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的根据”。实际上，《关于审理建设工程施工合同纠纷案件适用法律问题的解释》第21条所规定的以备案合同为依据并非绝对。从司法实践当中来看，如果建设方和施工方签订的两份合同版本不同，那么应当以备案的为准;反之，如果双方签订的两份合同版本相同，那么应当根据实际情况确定，如果私下签订的《建设工程施工合同》体现双方的真实意思，例如，变更了备案的《建设工程施工合同》，那么就应当以私下签订的《建设工程施工合同》为准，而不依据备案的《建设工程施工合同》。

综合上面所说的，施工合同签订好之后一般都是需要进行备案的，其目的性就是为了更好的维护双方的利益，而且施工合同与备案合同的内容一般的情况下都是一样的，只要合事备案成功，那么在后期出现矛盾时也会更好的解决。

一、合同如何结算工程价款

法律、行政法规规定必须进行招标的建设工程，或者未规定必须进行招标的建设工程，但依法经过招标投标程序并进行了备案，当事人实际履行的施工合同与备案的中标合同实质性内容不一致的，应当以备案的中标合同作为结算工程价款的依据。法律、行政法规规定不是必须进行招标的建设工程，实际也未依法进行招投标，当事人将签订的建设工程施工合同在当地建设行政管理部门进行了备案，备案的合同与实际履行的合同实质性内容不一致的，应当以当事人实际履行的合同作为结算工程价款的依据。